南宋程朱理学的代表人物之一朱熹晚年从神坛上跌落，后世的评论者大都将原因归咎于他的私生活——纳二尼姑为妾，此其一；大儿子死后遗孀竟能怀孕，此其二。
对这两件事的真实性，后世一直争论不休。不过，大多数的研究者认为事实确凿，理由是宋庆元二年御史沈继祖以十大罪弹劾朱熹时就包含这两条罪状。而受到宋庆宗申饬的朱夫子只是含混其词地以“深省昨非，细思今是”而认罪伏法。
“存天理，灭人欲”是程朱理学在继承儒家学术的同时及时创新的核心思想。
程朱理学对后世的影响极深。但也遭到了“泛人性论”的进攻和讨伐。特别是在宋朝时期的广大妇女深受其害，”贞烈观”成了女性身上的沉重枷锁，造成了无数的人间惨剧，与盛唐时期女性灿烂盛放形成了鲜明的对比。但此理学却成了皇权统治的有力武器，欲望低縻，平庸低能，官场噤声，狼性顿失，成为北夷、南蛮、西戎铁蹄抢夺的猎场，最终被外族所灭，元朝兴起。
所幸，朱熹被贬后不到九年，统治者由于自身的需要，重拾程朱理学，为朱熹评反，但由于这套理学与时代不合，最终导致南宋的灭亡。
一种思想，一种理念不可能成为万世之准绳，在一种文化大框架下对不合时宜的部分进行革新和扬弃，才是永葆活力的正确做法。
问渠哪得清如许？为有源头活水来。这是朱老夫子的极富哲理的名言，活水的激荡和冲涤才是渠水清清的保证。也许程朱理学“存天理，灭人欲”的极端思想才是朱熹跌落神坛的根本原因。