由于《四库全书》由乾隆敕编，为了维护清王朝统治的需要，名为“稽古右文”，实则“寓禁于征”，大量搜罗、查禁、删改、销毁书籍。根据流传至今的几种禁毁书目和有关档案记载，全毁于2400多种，抽毁书400多种，铲毁、烧毁书版七、八万块。同时大兴“文字狱”，《四库全书》开馆后10年内竟发生了48起“文字狱”。而古书亡矣!”连宋应星的科技著作《天工开物》也因为有碍于愚民而禁毁，文字狱如此。
善本：是指那些具有历史文物性、学术资料性和艺术代表性，或在其中某一方面有特殊价值的书本。一般来说，刊刻年代较早或经过精心校勘而错误较少的版本可称为善本。
孤本：某书的某一刻本或手稿。拓本在世间只有一份流传的为孤本。
秘本：私人收藏者秘藏于家室，置之高阁，不准许外人见阅的版本为秘本。
禁毁本：前代或当世之因遭禁被毁，侥幸私存下来的版本为禁毁本。在古代，保存这种禁毁本十分危险，一旦被当局发现，必遭大祸，因而其流传极其艰难。弥足珍贵。
绣像本：书中间有插图的版本为绣像本。这类绣像本书因其生动的表现形式而倍受欢迎，但因绘刻工艺复杂，价格昂贵而成品较少，因而现存的十分珍贵。
石印本：精选坚硬宽大而表面平滑的石头经打磨、雕刻制成石版，再用药墨将文字写在特制药纸上，将药纸上的字迹移置到石版上，然后滚刷油墨印成的书为石印本。
手抄本：根据底本抄写而成的书本。其中有一种影抄本，是把透明纸覆在底本上面，按其原有字体、行款照样摹写的书本。
残本：在流传过程中因种种原因(如运输、转卖、转抄、争执等)而残缺不全的书本为残本。
补本：对前代前人的著作有所增补，加以已意而写成的书。
续书：对前代前人的著作内容做继续的描写，以延续原著的意思为主旨。
保留本：因为某种私人目的而专门保留起来的书，一般是传家世代收藏保留，视为至宝。
经部：易类、书类、诗类、礼类、春秋类、孝经类、五经总义类、四书类、乐类、小学类。
史部：正史类、编年类、记事本末类、别史类、杂史类、诏令奏议类、传记类、史钞类、载记类、时令类、地理类、职官类、政书类、目录类、史评类。